研究人员汇集数据以更好地对胃肿瘤的预后进行分类

研究人员汇集数据以更好地对胃肿瘤的预后进行分类

在2022年IGCC的一次演讲中，Ju-Seog Lee博士讨论了一项分析，该分析结合了肿瘤分类模型，以推导出胃癌中新的预后亚组。——美国看病

根据2022年国际胃癌会议上的一篇演讲，分析了从各种胃癌分类系统收集的基因组学数据，以确定是否可以从不同调查团队的努力中达成共识。——美国看病

"肿瘤的分类是成功治疗胃肿瘤患者的关键，[包括]常规分期，如TNM和WHO [世界卫生组织]分类，已成功用于此目的，"休斯顿德克萨斯大学MD安德森癌症中心系统生物学系副教授Ju-Seog Lee博士说。 在介绍数据时说。"然而，有一些局限性，因为它没有反映胃肿瘤的潜在生物学，这是靶向治疗的关键。——美国看病

Lee说，不同的小组已经尝试使用基因组学，蛋白质组学和代谢组学来定义胃亚型 - 例如他自己的小组之前确定了2种不同的分子亚型，称为间充质表型（MP）和上皮表型（EP）。2他的研究小组探索的其他预后信号包括Hippo通路的激活或失活，爱泼斯坦 - 巴尔病毒（EBV）的存在，微卫星不稳定性（MSI）状态以及体细胞拷贝数改变的数量。——美国看病

"它并不止于此。许多其他研究人员也发现了与预后差异密切相关的不同疾病亚型，这是一个巨大的进步，"李说。"然而，它提出了新的和不同的问题[这些系统]如何彼此相似，以及基于基因组方法的这些不同分类之间是否存在任何共识。——美国看病

方法

为了解决临床问题，研究人员收集了确定的8个预后亚组的基因组数据。其中包括：

1、按内在亚型划分的组织学

2、河马通路表达

3、癌症基因组图谱计划（TCGA4）确定的四种分子亚型

4、TCGA 风险评分 （TRS）

5、亚洲癌症研究小组（ACRG）亚型

6、延世癌症中心亚型

7、LNC6 亚型

8、百万像素

总共有2527个样本的基因表达谱数据，其中1427个在训练集中，1100个在验证集中。每种药物都有临床数据。——美国看病

作为研究的一部分，Lee及其同事使用来自8个分类的信息，在称为集群集群分配的过程中进一步分析患者，以得出6个新的肿瘤亚型。他指出，这些新组来自先前的分类而不是基因组数据，与结果最好的第5组和第6组相比，第1组的结果最差。——美国看病

组间差异包括第5亚组中的高突变负荷，具有高度突变的HER3和HER4。第3组和第4组的拷贝数变化最高。——美国看病

真实世界验证

Lee转向了3期ARTIST试验（NCT00323830），该试验检查了卡培他滨加顺铂（XP）单独与XP联合放疗（XP / RT）在治愈性切除胃癌和D2淋巴结清扫术患者中的比较。——美国看病

研究人员在ARTIST试验的可用RNA样本上使用NanoString技术，根据患者的表达特征对其进行细分。有趣的是，除第3组外，大多数亚组都反映了XP和XP / RT的相似结果，这应通过增加放射治疗产生统计学上显着的益处。——美国看病

"这表明可能有一小部分患者在辅助治疗中受益于放射治疗，"Lee说。

亚型的特征在于大量拷贝数改变，低甲基化，mRNA的中度至高表达以及高水平的HER2表达。这也是唯一一个以对放射治疗高反应为特征的亚组。——美国看病

最后，Lee回顾了6种新定义的胃癌亚型的特征，并指出需要进一步的研究来验证结果（TABLE）。——美国看病