美国看病资讯tRNA衍生片段的甲基化调节膀胱癌中的基因沉默活性

美国看病资讯tRNA衍生片段的甲基化调节膀胱癌中的基因沉默活性

Anindya Dutta，MBBS，Ph.D.及其同事描述了一种在膀胱癌中改变的新型基因调控形式，导致基因途径的增强，该基因途径有助于癌细胞在快速生长过程中存活。——美国看病

他们的工作重点是称为tRF-3b的转移RNA的22碱基片段，该片段由称为TRMT6 / 61A的酶复合物修饰。在膀胱癌中，TRMT6/61A（一种将甲基转移酶添加到tRF-3bs的第四碱基上）的水平升高。这种修饰可防止tRF-3bs沉默癌细胞中未折叠的蛋白质反应途径中各种基因的表达，从而导致这些基因的表达增加。——美国看病

“据我们所知，这是基于N的TRMT6 / 61调节microRNA样基因沉默的第一个例子。1- 甲基腺苷修饰，我们的报告提供了一种机制，通过该机制，癌症中观察到的TRMT6 / 61A的升高可以影响基因表达，“Dutta说。“快速增殖的癌细胞合成和折叠的蛋白质比正常细胞多得多，因此需要上调未折叠的蛋白质反应途径以维持蛋白质稳态。我们发现，膀胱癌细胞激活促生存展开的蛋白质反应以减轻内质网应激的一种方式是通过防止tRF沉默参与这种未展开的蛋白质反应的基因的表达。——美国看病

“未展开的蛋白质反应与癌症进展的许多方面密切相关，并已成为一个有希望的治疗靶点，”Dutta说。“之前已经注意到，未折叠的蛋白质反应相关基因在包括膀胱癌在内的几种癌症类型中在全球范围内上调，因此我们的研究结果表明，抑制TRMT6 / 61A酶可能是治疗膀胱癌的新方法。——美国看病

Dutta和共同通讯作者Rune Ougland，M.D.，Ph.D.的研究包括对接受经尿道膀胱肿瘤切除术的患者获得的膀胱癌组织的分析。它发表在《自然通讯》杂志上。 Dutta是阿拉巴马大学伯明翰分校遗传学系主任，Ougland是挪威奥斯陆奥斯陆大学Rikshospitalet医院的泌尿外科医生和高级研究调查员。——美国看病

该研究的一个重要进展是用于从具有N的小RNA的人类细胞中创建文库的工作流程。1-甲基腺苷修饰，或m1一个。工作流结合了两种独立的方法 — 通过 m 进行扩充1A抗体，然后进行小RNA测序和m1通过测序诱导的A型不匹配特征。——美国看病

UAB研究人员发现，通常用于短RNA测序的逆转录酶ProtoScriptII在检测含有m的小RNA方面做得很差。1A;但是在工作流程中使用另外两种逆转录酶表明，tRNA衍生的片段（包括tRF-3b）在短RNA中富集。这表明小RNA具有m1修饰在大多数通常使用ProtoScriptII的小型RNA序列库中代表性不足。——美国看病

随着工作流程的改进，研究人员发现1在人类小RNA中，主要存在于tRF上。他们还发现，m1一种修饰在核编码的tRFs和线粒体编码的tRF上都是高度特异性和普遍的，并且m1在核编码的tRNA中发现的tRF-3b是由TRMT6 / 61A复合物介导的。——美国看病

如何进行 m1A-tRF-3b阻碍了基因沉默？答案涉及更深入地研究分子遗传学，但关键似乎是N1-甲基腺苷修饰破坏了常规的沃森-克里克碱基配对。——美国看病

已知MicroRNA通过与RNA诱导的沉默复合物或RISC结合来沉默基因。在那里，它们充当结合互补信使RNA的模板，然后信使RNA被RISC沉默和降解。与microRNA类似，tRF-3s已在不同的生物学途径中被发现，特别是依赖于小RNA（在这种情况下为tRF-3s）和靶RNA之间的碱基配对的基因沉默途径。——美国看病

研究人员创建了一个荧光素酶报告测定，发现未修饰的tRF-3触发了基因沉默，而m1A-修饰的tRF-3b废除了基因沉默。“自 m1A 中断规范碱基配对，我们假设 m 的弱化碱基配对1TRF-3中具有靶信使RNA的A解释了在m中观察到的基因沉默活性降低1含有TRF-3的A，“杜塔说。——美国看病

与Dutta和Ougland共同撰写的研究中，“tRNA衍生片段的TRMT6 / 61A依赖性碱基甲基化调节膀胱癌中的基因沉默活性和未展开的蛋白质反应”，是UAB遗传学系的张利苏;Ida Monshaugen和Arne Klungland，奥斯陆大学医院Rikshospitalet;以及弗吉尼亚大学的Briana Wilson和Fengbin Wang。——美国看病