出国看病资讯研究人员创建单细胞框架，以潜在地增强CAR T细胞治疗

出国看病资讯研究人员创建单细胞框架，以潜在地增强CAR T细胞治疗

圣裘德儿童研究医院的科学家已经证明，在某些情况下，可以在治疗前预测癌症杀伤性嵌合抗原受体（CAR）T细胞的长期性能。该研究提供了一个独特的基于细胞测序的框架来测量和改善CAR T细胞免疫治疗性能。该报告今天在线出现在癌症发现中。——出国看病

CAR-T细胞通过利用患者的免疫系统来识别和杀死癌细胞来工作。免疫疗法已被证明可有效治疗患有白血病和淋巴瘤的儿童和成人，但随着时间的推移，这种疗法有时会失败或摇摇欲坠。——出国看病

利用实验室中的先进技术，圣裘德研究人员在准备治疗的CAR T细胞总数组中鉴定出一小部分CAR T细胞，当输注给急性淋巴细胞白血病（ALL）儿童时，其产生大部分持久的抗癌活性。——出国看病

科学家们创建的方法学框架作为模板，通过提供导航这些免疫疗法复杂性的指南来改善其他CAR T细胞疗法。——出国看病

“这是一个令人惊讶的发现，”共同通讯作者Paul Thomas博士说，圣裘德免疫学系。“看起来非常小的比例，当然是输注前产物中的少数CAR阳性T细胞，实际上有助于患者的抗肿瘤反应。——出国看病

在研究之前，研究人员假设在单一制剂中创建的大多数CAR T细胞都是相似的，癌症清除活性代表这些制备细胞的平均活性。——出国看病

“我们表明，在这种情况下，一小群细胞是癌症清除的驱动力，”共同通讯作者Jeremy Chase Crawford博士说。“发现治疗驱动细胞的能力对于证明这一点很重要，因为将来这种方法的改进版本可用于识别和丰富对患者有帮助的输注细胞，而不是对患者有帮助的细胞。——出国看病

潜在成功的标志

科学家们在输注前的CAR-T细胞中发现了一种独特的基因表达“特征”，这种细胞成为效应T细胞，这种免疫细胞杀死了癌细胞。研究小组在该特征中发现了三个基因，这些基因编码了在T细胞表面表达的蛋白质。携带表面蛋白特定组合的细胞成为效应T细胞;其他CAR-T细胞变得功能失调。——出国看病

存在按表面标记物对细胞进行分类的技术，可用于丰富CAR T细胞制剂，以仅包括注定要成为有效癌症杀手的细胞。研究人员澄清说，本研究中鉴定的细胞表面标志物可能是CAR T细胞，ALL和患者群体的组合所独有的。但研究人员开创的方法可以证明如何改进其他CAR T细胞疗法。——出国看病

为了找到这种特征，研究人员在实验室中收集了CAR-T细胞，然后将其给予患者（预输注）。研究人员后来从患者那里收集了血液样本，研究进行了数周和数月。他们能够使用单细胞RNA测序跟踪输注的CAR T细胞的命运。——出国看病

“现在，”托马斯说，“CAR产品的几乎所有东西都是在批量水平上进行评估的。我们表明，你需要观察单细胞水平来定义那些将成为患者关键效应的细胞的表型。——出国看病

用于识别 CAR T 细胞后代的条形码

研究人员的新方法将T细胞“条形码”与儿科癌症患者的单细胞基因表达测序相结合。这使他们能够遵循T细胞谱系。从患者身上采集的每个原始T细胞谱系都有一种独特的蛋白质，称为T细胞受体（TCR）。在患者中，活化的CAR-T细胞在遇到癌细胞后会分裂和增殖。因此，来自具有相同TCR的患者的每个T细胞都来自相同的原始T细胞谱系，该谱系在输注前在实验室中进行了修饰。因此，TCR可以充当CAR T细胞特定谱系的条形码。——出国看病

科学家们对输液前细胞和治疗后患者样本中的TCR进行了测序。使用机器学习，研究人员比较了单细胞测序的遗传转录本，看看细胞是否成为效应器。通过这种追踪，研究人员发现，一小部分输液前细胞，特别是那些具有前遗体特征的细胞，成为效应器并在患者中增殖。

由于圣裘德的跨部门合作努力，旨在整合临床试验和基础免疫学研究，称为转化免疫学和免疫治疗中心（CeTI2），因此首次此类研究成为可能。科学家从一项名为SJCAR19的临床试验中获得样本，这是圣裘德第一个由研究人员发起的CAR T细胞治疗研究，由研究合著者Aimee Talleur，医学博士，圣裘德骨髓移植和细胞治疗部门领导。——出国看病

“这项研究展示了一个巨大的团队努力，并将来自基础科学和临床的研究人员聚集在一起，”联合通讯作者Stephen Gottschalk博士，圣裘德骨髓移植和细胞治疗系主席说，“它突出了团队科学的优点和单细胞技术与大数据分析相结合的前景，以开发有效的癌症细胞免疫疗法。——出国看病